工程审计是控制工程预算的有效措施，它可以提高工程资金的使用效率，对整个工程项目起到了监督检查的作用。随着经济的快速发展，我国开展的大型工程也相应的增多，工程项目审计在工程建设经济活动中起了越来越重要的作用。我国在工程审计中也相应地借鉴了国外的一些先进的技术，通过科学有效的创新管理，不断的丰富工程审计的项目和类型，推动了我国工程建设方面的重大发展。接下来我们具体讨论工程审计在工程预算控制中的有效作用。
工程预算编制竣工结算时，暂估价中的材料单价应按发承包双方终确认的材料单价替代各暂估材料单价后调整综合单价。暂估价中的专业工程金额应按各专业工程的中标价或发包人、承包人与分包人终确认的专业工程总价计算。计日工是指在施工过程中，承包人完成发包人提出的工程合同范围以外的零星项目或工作所需的费用沟槽土石方，按设计图示沟槽长度乘以沟槽断面面积，以体积计算。条形基础的沟槽长度，设计无规定时，按下列规定计算。外墙沟槽，按外墙中心线长度计算。突出墙面的墙垛，按墙垛突出墙面的中心线长度，并入相应工程量内计算。。
工程预算如果是预算结算承包，审计的重点是核查乙方提出的设计变更资料是不是通过了原来设计部门的同意或是经过了甲方的签证，这里的重大设计变更有没有计划或者是主管部门的审批手续，变更工程量的计算是不是真实，套用定额与单价是不是合适且准确，设计变更的增减是不是同步，有没有巧立名目、自行定价、搭车收费的现象。预算加系数或是平方米等价已经承包，审计的重点原则上已经把预算的变动，加价系数等算在内，因此不应该再零星项目变动经济洽谈。如果是招标承包，审计的重点是结算应该按中标合同的标价执行，当然遇到特殊复杂工程可以调价，也要有补充的合同，否则就不应该在 的结算关头再另行加价。
安装工程预算挖掘机在垫板上作业时，相应定额项目人工、机械乘以系数1.25。挖掘机下铺设垫板、汽车运输道路上铺设材料时，其费用按施工组织设计另行计算。人工开挖底宽≤7m且底长＞3倍沟槽或底面积≤150m2基坑以外的土石方，其垂直提运按垂直深度每米折合水平运距5m计算。土石方外运距离按≤30km编制。超出该运距上造价的土石方运输，不适用定额未包含弃土处理费用，发生时，另行计算。淤泥、流砂运输按即挖即运考虑。对没有即时运走经晾晒后的淤泥、流砂按运一般土方定额项目计算。